R语言层次聚类、多维缩放MDS分类RNA测序(RNA-seq)乳腺发育基因数据可视化|附数据代码
在生物学和医学研究中,乳腺发育是一个复杂而精细的过程,涉及众多基因的表达调控。
在生物学和医学研究中,乳腺发育是一个复杂而精细的过程,涉及众多基因的表达调控。
聚类分析是一种常见的数据挖掘方法,已经广泛地应用在模式识别、图像处理分析、地理研究以及市场需求分析。
最近我们被客户要求撰写关于上海空气质量指数的研究报告。
对“NCI60”(癌细胞系微阵列)数据使用聚类方法
本文通过一些指数对散点图矩阵和平行坐标显示中的面板进行排序,并根据其数值水平对面板进行着色。
《世界幸福报告》是可持续发展解决方案网络的年度报告,该报告使用盖洛普世界民意调查的调查结果研究了150多个国家/地区的生活质量。
(a)部分:k-means聚类
使用k-means聚类法将数据集聚成2组。
画一个图来显示聚类的情况
使用k-means聚类法将数据集聚成3组。
画一个图来显示聚类的情况
(b)部分:层次聚类
使用全连接法对观察值进行聚类。
使用平均和单连接对观测值进行聚类。
绘制上述聚类方法的树状图。
最近我们被客户要求撰写关于聚类技术的研究报告。为了说明层次聚类技术和k-均值,我使用了了城市温度数据集,其中包括几个城市的月平均气温。
R语言中实现层次聚类模型
本文在iris数据集上展示了如何使用R软件来建立Hierarchical Cluster Analysis层次聚类分析(更好的可视化和灵敏度分析)。
聚类分析算法很多,比较经典的有k-means和层次聚类法。
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