R语言画ROC曲线总结

 在本文中,我描述了如何在CRAN中搜索用于绘制ROC曲线的包,并重点介绍了六个有用的包。

尽管我从一些我想谈论的软件包开始就有了一些想法,例如ROCRpROC(我在过去发现它们很有用),但我还是决定使用 相对较新的软件包pkgsearch来搜索CRAN并查看其中的内容。 

package_search()函数将文本字符串作为输入,并使用基本的文本挖掘技术来搜索所有CRAN。

经过一番尝试和错误之后,我确定了以下查询,其中包括许多与ROC相关的有趣软件包。

为了完成选择过程,我做了艰苦的工作,浏览软件包的文档,以挑选出我认为通常对大多数数据科学家有用的内容。下图使用了Guangchuang Yu的dlstats软件包,查看我选择分析的六个软件包的下载历史记录。

2005年

以下代码ROCR使用包装随附的综合数据集设置并绘制默认的ROC曲线。在整个文章中,我将使用相同的数据集。

2010

 pROC也受到数据科学家的欢迎。我喜欢AUC在图中绘制曲线下面积的置信区间非常容易。

2014年

 该roc.curve()函数 会绘制出干净整齐的ROC曲线 。

2014年

该软件包提供了许多功能丰富的ggplot()几何图形 。 

 2015年

precrec 是另一个用于绘制ROC和精确调用曲线的库。

evalmod()函数的参数选项使生成各种模型特征的基本图变得容易。

2019

ROCit是一个用于绘制ROC曲线和其他二进制分类可视化效果的新程序包 ,并且正在迅速普及。 

 下图显示了正响应和负响应的累积密度。KS统计数据显示两条曲线之间的最大距离。


可下载资源

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关于作者

Kaizong Ye拓端研究室(TRL)的研究员。

本文借鉴了作者最近为《R语言数据分析挖掘必知必会 》课堂做的准备。


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