R语言中自编基尼系数的CART回归决策树的实现

这里的想法是使距离最大化:想法是区分,所以我们希望样本尽可能不独立。要计算基尼系数。

 本文为了说明回归树的构造(使用CART方法),考虑以下模拟数据集,

> set.seed(1)
> n=200
> X1=runif(n)
> X2=runif(n)
> P=.8*(X1<.3)*(X2<.5)+
+   .2*(X1<.3)*(X2>.5)+
+   .8*(X1>.3)*(X1<.85)*(X2<.3)+
+   .2*(X1>.3)*(X1<.85)*(X2>.3)+
+   .8*(X1>.85)*(X2<.7)+
+   .2*(X1>.85)*(X2>.7) 
> Y=rbinom(n,size=1,P)  
> B=data.frame(Y,X1,X2)

具有一个因变量(感兴趣的变量)和两个连续的自变量( 变量​ 和​)。


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> tail(B)
    Y        X1        X2
195 0 0.2832325 0.1548510
196 0 0.5905732 0.3483021
197 0 0.1103606 0.6598210
198 0 0.8405070 0.3117724
199 0 0.3179637 0.3515734
200 1 0.7828513 0.1478457

理论分区如下

在这里,可以将样本绘制在下方(请注意,第一个变量在上方的y轴上,在下方的x轴上),蓝色点   等于1,红色点等于0,

> plot(X1,X2,col="white")
> points(X1[Y=="1"],X2[Y=="1"],col="blue",pch=19)
> points(X1[Y=="0"],X2[Y=="0"],col="red",pch=19)

为了构造树,我们需要一个分区critera。最标准的可能是Gini的索引,当将s分为两类时,可以写出该索引,  在此表示 

或  将分为三类时,表示为 

等等,这里​ 只是属于分区的观测值的计数,  ​ 其   取值为​。但是可以考虑其他标准,例如卡方距离,

在传统上,当我们考虑两个等级时,或者在三个等级的情况下。

同样,这里的想法是使距离最大化:想法是区分,所以我们希望样本尽可能不独立。要计算基尼系数,请考虑

> GINI=function(y,i){
+ T=table(y,i)
+ nx=apply(T,2,sum)
+
+
+ 
+ 
+ 
+ }

我们只需构造列联表,然后计算上面给出的数量。首先,假设只有一个解释变量。我们将样本一分为二,并使用所有可能的分割值​,即

然后,我们为所有这些值计算基尼系数。结是使基尼系数最大化的值。有了第一个节点后,我们将继续保留(从现在开始将其称为​)。

我们通过寻找最佳第二选择来重申:给定一个根节点,考虑将样本一分为三的值,并给出最高的基尼系数,因此,我们考虑以下分区

或这个

也就是说,我们在上一个结的下方或上方分割。然后我们进行迭代。代码可以是这样的,


> for(s in 1:4){
+ for(i in 1:length(u)){


+ vgini[i]=GINI(Y,I)


+ }
+ 
+ 
+ cat("knot",k,u[k],"\n")
+ 
+ 
+ }
knot 69 0.3025479 
knot 133 0.5846202 
knot 72 0.3148172 
knot 111 0.4811517

第一步,基尼系数的值如下:

最高约为0.3。然后,我们尝试分三部分构造一个分区(拆分为0.3以下或以上)。我们得到以下基尼系数图(作为第二个节点的函数)

 当样本在0.6左右分裂(这成为我们的第二个节点)时最大。等,现在,让我们将代码与标准R函数进行比较,

node), split, n, deviance, yval
      * denotes terminal node

 1) root 200 49.8800 0.4750  
   2) X2 < 0.302548 69 12.8100 0.7536 *
   3) X2 > 0.302548 131 28.8900 0.3282  
     6) X2 < 0.58462 65 16.1500 0.4615  
      12) X2 < 0.324591 7  0.8571 0.1429 *
      13) X2 > 0.324591 58 14.5000 0.5000 *
     7) X2 > 0.58462 66 10.4400 0.1970 *

我们确实获得了类似的结:第一个为0.302,第二个为0.584。因此,构造树并不难…

现在,如果我们考虑两个解释变量,该怎么办?保持不变,除了分区的编写现在变得更加复杂。为了找到第一个节点,我们考虑了两个分量的所有值,然后再次保持最大化基尼指数的值,


> plot(u1,gini[,1],ylim=range(gini),col="green",type="b",xlab="X1",ylab="Gini index")
> abline(h=mg,lty=2,col="red")
> if(i==1){points(u1[which.max(gini[,1])],mg,pch=19,col="red")
+          segments(u1[which.max(gini[,1])],mg,u1[which.max(gini[,1])],-100000)}
> u2[which.max(gini[,2])]
[1] 0.3025479

这些图如下所示并获得了右侧的分区,

或者我们分割第二个分区(然后得到以下分区),

在这里,最好先分割第二个变量。实际上,我们回到了前面讨论的一维情况:正如预期的那样,最好在0.3左右进行分割。以下代码已确认这一点,


     var   n       dev      yval splits.cutleft splits.cutright
1     X2 200 49.875000 0.4750000      <0.302548       >0.302548
2     X1  69 12.811594 0.7536232      <0.800113       >0.800113
4 <leaf>  57  8.877193 0.8070175                               
5 <leaf>  12  3.000000 0.5000000

对于第二个结,应考虑四种情况:在第二个变量上再次分裂(再次),在上一个结之上或之下(请参见左下方)或在第一个变量分裂。然后在上一个结的下方或上方设置一个分区(请参见右下方),

为了使树可视化,代码如下

注意,我们也可以可视化该分区。


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关于作者

Kaizong Ye拓端研究室(TRL)的研究员。

本文借鉴了作者最近为《R语言数据分析挖掘必知必会 》课堂做的准备。

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