最近我们被客户要求撰写关于聚类技术的研究报告。为了说明层次聚类技术和k-均值,我使用了了城市温度数据集,其中包括几个城市的月平均气温。
我们有15个城市,每月进行一次观测
可下载资源
boxplot(temp[,1:12],main="月平均温度")
由于方差看起来相当稳定,我们不会将这里的变量“标准化”,
> apply(月份,2,sd)
视频
主成分分析PCA降维方法和R语言分析葡萄酒可视化实例
视频
KMEANS均值聚类和层次聚类:R语言分析生活幸福质量系数可视化实例
为了得到一个层次聚类分析,使用实例
 hclust(dist , method = "ward")
 

另一种选择是使用
 
> plot(h2)
在这里,我们用主成分分析将观察结果可视化。我们这里还有一个自动选择类的数目,这里是3个。我们可以得到组的描述
或直接
 cutree(cah,3)
我们也可以自己可视化这些类,
 PCA(X,scale.unit=FALSE)
 plot(  ind$coord[,1:2],col="white")
 text( ind$coord[,1],acp$ind$coord[,2],
 
可以绘制出这些簇的中心点
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 > points(PT$Dim.1,PT$Dim.2,pch=19)
如果我们在这些中心周围添加Voronoi集,我们看到的是中间的点,恰好是三个区域的交点
vormo(PT$Dim.1,PT$Dim.2)
plot(V,add=TRUE)
要可视化这些区域,请使用Voronoi图,它又叫泰森多边形或Dirichlet图。
Voronoi图是由一组由连接两邻点直线的垂直平分线组成的连续多边形组成。
 p=function(x,y){
+   which.min((PT$Dim.1-x)^2+(PT$Dim.2-y)^2)
image(vx,vy,z,col=c(rgb(1,0,0,.2),
实际上,这三组(和这三个区域)也是我们用k-均值算法得到的,
kmeans(coord[,1:2],3)
K-means clustering 
with 3 clusters of sizes 3, 7, 5
由于我们有一些空间数据,我们可以在地图上把它们可视化
points(Long,Lati,col=groups.3)
或者,为了可视化这些区域,使用
 for(i in 1:3) 
+ Ellipse( Long[groups.3==i],



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