R语言多维数据层次聚类散点图矩阵、配对图、平行坐标图、树状图可视化城市宏观经济指标数据

本文通过一些指数对散点图矩阵和平行坐标显示中的面板进行排序,并根据其数值水平对面板进行着色。

由Kaizong Ye,Sherry Deng撰写

显示相关矩阵

cor <- cor(ley)
leclr <- mat.colr(cor)

mtcolr 根据相关性大小为相关性分配三种颜色。高相关性为红色,中间三分之一为蓝色,底部三分之一为天蓝色。

plclrs(lolr,label=ronms(coor)

如果要更改配色方案:

leolo <- colr(cor, brak=FALE)
lecor <- tcor(cor, bes, 
                            c.cr(4))

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KMEANS均值聚类和层次聚类:R语言分析生活幸福质量系数可视化实例

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如果在绘图之前重新排列变量,则绘图更容易解释。

oge <- rdclust(lnlcor)
lgeolor1 <- nlclor\[lne.,lo.\]
plot(lnco1,dlbls=rwe(ngyr1))

显示带有彩色面板的配对图

所有高相关面板一起出现在一个块中的一个版本。

pais(loly, orr= lolo,acor= lgy.or)

如果 order 未提供 ,则按默认数据集顺序绘制变量。

用彩色面板显示平行坐标图

平行坐标图面板可以着色的版本 。同样,红色面板具有高相关性,蓝色面板具有中等相关性,天蓝色面板具有低相关性。

pard(lng, ordr= loyo,color= colr, 
          horol=TRUE)

绘制重新排序的树状图

dist 是一个内置的距离矩阵,给出了城市之间的距离。

hclst(dis, "ave")
plt(hc)

重新排序树状图以提高附近分支之间的相似性。将其应用于 hc 对象:


R语言k-means聚类、层次聚类、主成分(PCA)降维及可视化分析鸢尾花iris数据集

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ordeu(hc, dis)


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两个树状图对应于相同的树结构,但第二个树状图显示巴黎和瑟堡比离慕尼黑更近,罗马离直布罗陀比离巴塞罗那更近。

我们还可以将两种排序与颜色的图像图进行比较。第二个排序似乎将附近的城市彼此靠近。

ct <- dor(edt, rev(cs(5)))
pltcl(cma, rles=lals)


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关于作者

Kaizong Ye拓端研究室(TRL)的研究员。Kaizong Ye拓端研究室(TRL)的研究员。在此对他对本文所作的贡献表示诚挚感谢,他在上海财经大学完成了统计学专业的硕士学位,专注人工智能领域。擅长Python.Matlab仿真、视觉处理、神经网络、数据分析。

本文借鉴了作者最近为《R语言数据分析挖掘必知必会 》课堂做的准备。

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